Зависит, наверное, от того, какого результата вы хотите добиться.
Лучше всего разделить фильм на отрывки минут по 10 (или сразу искать короткие ролики). Посмотрели без субтитров → посмотрели заново с субтитрами → выписали (запомнили) интересные фразы. 
Если вы не будете акцентировать внимание на каких-то моментах, а обращать внимание только на то, что поняли, эффекта будет мало. Ваша цель - разобрать то, что вы не поняли сразу; то, что для вас ново. Здесь вам могут и должны помочь субтитры.
Если вы включаете субтитры сразу, задача упрощается. Но тогда вы и не понимаете, на чем бы вы застопорились в реальной жизни, где субтитров нет. С другой стороны, работает сразу два восприятия: на зрение и на слух. То, что вы читаете, ассоциируется у вас с произносимыми словами. Это тоже хорошо. Так что лучше смотреть дважды: с субтитрами и без. Второй раз не пересматриваете, только если все достаточно хорошо расслышали и поняли.

---

И еще одно: в фильмах, очень часто, субтитры не полностью соответствуют речи, т.е. смысл тот, а конструкция - другая. Это может сбивать.